Interpretación de resultados de la Secuenciación de Sanger
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El método de secuenciación de Sanger se basa en la acción de las ADN polimerasas. Estas enzimas tan importantes para nuestras células son capaces de unirse a una cadena de ADN la cual, gracias a la presencia de un primer, puede añadir nucleótidos a la cadena principal, permitiendo la síntesis de una nueva cadena. La secuenciación de Sanger es considerada como un método gold standard y siempre ha sido el perfecto complemento para el trabajo con clonación.
Esto aprenderás:
- Fundamentos de la biología molecular para la secuenciación de Sanger.
- Secuenciación de primera y segunda generación; tecnologías actuales de secuenciación y su modo de funcionamiento – secuenciación de Illumina Solexa, Roche 454 y Ion Torrent.
- Cromatogramas que se obtienen como resultado de una secuenciación de Sanger, características comunes de las trazas y distorsiones. Métricas de calidad de datos.
- Tipos de muestras que se pueden enviar a secuenciar y cómo prepararlas correctamente. Muestras de tipo producto PCR, plásmidos, placas Petri y librerías.
- Cómo enviar a secuenciar una muestra e interpretar los resultados obtenidos utilizando el software Geneious Prime.
Requisitos:
- Conocimientos nivel medio de biología molecular y básico de matemática
- Computadora básica con cualquier sistema operativo
- Conexión a internet
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6Tecnologías de secuenciación
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7Introducción a la secuenciación de Sanger y por qué secuenciamos
En este video encontrarás la explicación de la primera parte del capítulo 2
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8NGS - tecnologías Illumina Solexa y Ion Torrent
En este video encontrarás la explicación de la segunda parte del capítulo 2
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9Electroferogramas
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10Principios de la secuenciación de Sanger y características de los cromatogramas
En este video encontrarás la explicación de la primera parte del capítulo 3
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11Interpretación de cromatogramas y asignación de bases
En este video encontrarás la explicación de la segunda parte del capítulo 3
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12Preparación de las muestras
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13Productos PCR - dilución de la muestra y envío de primers
En este video encontrarás la explicación de la primera parte del capítulo 4
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14Plásmidos, placas Petri y librerías
En este video encontrarás la explicación de la segunda parte del capítulo 4
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15Problemas comunes en la lectura de secuencias y cómo resolverlos
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16Envío de muestras a Genewiz - Azenta Life Science
En este video encontrarás la explicación de la primera parte del capítulo 5
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17Recepción de resultados de Genewiz
En este video encontrarás la explicación de la segunda parte del capítulo 5
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18Análisis de secuencias en Geneious Prime
En este video encontrarás la explicación de la tercera parte del capítulo 5
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19Soluciones para problemas de resultados de la secuenciación de Sanger
En este video encontrarás la explicación de la cuarta parte del capítulo 5
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